小智（松本梨香 配音）一行人继续着磨练技艺的旅途，他们来到了欧鲁德朗城，这里正在举行为了纪念百年前阻止了战争的勇者亚朗而设置的对战祭典。小智带着皮卡丘（大谷育江 配音）勇敢参战，并且最终凭借着强大的实力夺得了头筹，获得了珍贵的宝物“勇者之杖”。　　然而，让小智没有想到的是 ，传说中的神奇宝贝路卡利欧竟然从杖中现身，它的重现江湖揭开了一个隐藏了百年的秘密。与此同时，神秘莫测的神奇宝贝梦幻现身会场，掳走了皮卡丘和喵喵。为了找回皮卡丘，小智和贝路卡利欧踏上了旅途，他们的终点是世界初始之树，在那里隐藏着一切问题的答案。一无所获，楚翔把视线从地图上收回来道：“既然我们几人想不出办法，那么可以发动外面的人，如果真的找不到武器，那么只有放弃走铁路线，我们现在有一辆卡车，一辆越野车，再多找两辆车就可以把基地中人口全部拉走，不过最好还是要找到武器，因为走公路也更需要有武器防身。”